Het Saramaccakanaal is een cruciale ader voor de waterhuishouding van Paramaribo en omstreken en een deel van Wanica en Saramacca, maar door de overmatige groei van waterplanten en sedimentatie loopt de doorstroming ernstig gevaar. De enorme matten van waterplanten (vooral waterhyacinten) sluiten het wateroppervlak volledig af. Hierdoor kan er geen zuurstof vanuit de lucht in het water dringen.

Door de dichtgroei en het achterstallig onderhoud aan sluizen en gemalen stroomt het water nauwelijks. Dit bevordert de groei van bacteriën. Onder de plantenlaag sterven planten en vissen af. Omdat er geen zuurstof is, gaan bacteriën dit organisch materiaal afbreken met als gevolg die typische rotte-eierlucht. Huishoudelijk afval en lozingen van bedrijven verergeren de situatie. Dit dient als "voedsel" voor de planten en bacteriën, waardoor het proces versnelt.

Bewoners langs het kanaal vinden het jammer dat het kanaal er zo verwaarloosd bij staat en bijna dagelijks geconfronteerd worden met die vieze stank. Ook varen er geen boten meer voorbij zoals ze dat voorheen gewend waren. Gezellig langs het water zitten en vanuit je tuin genieten is niet meer mogelijk.

Als het kanaal dichtgroeit, kan het overtollige regenwater uit de omliggende woonwijken niet snel genoeg worden afgevoerd naar de Surinamerivier of de Saramaccarivier. Dit leidt bij zware regenval direct tot wateroverlast.

De toegankelijkheid voor kleine vaartuigen is volledig belemmerd. Het stilstaande water door blokkades bevordert de kweek van muskieten en leidt tot stankoverlast.

Momenteel wordt volgens het ministerie van Openbare Werken gewerkt aan een grootschalig herstelplan, grotendeels gefinancierd door de Wereldbank. De focus ligt op grootschalige baggerwerkzaamheden, waarbij het verwijderen van jaren aan opgehoopt slib en vuil centraal staat. Het verwijderen van de dichte begroeiing (waterhyacinten en andere invasieve planten) die de doorstroming blokkeren en de renovatie van sluizen en pompgemalen maken hier deel van uit. Het gaat om het moderniseren van de infrastructuur bij Uitkijk en Saramaccadoorsteek om het waterpeil actiever te kunnen reguleren.

Het Saramaccakanaal dient niet alleen voor afwatering, maar speelt ook een belangrijke rol in de ecologie van het gebied. De uitdaging is om het kanaal schoon te houden zonder het lokale ecosysteem volledig te verstoren.